Wie lange hast du denn die Tests mit den kurzen Kabeln laufen machen? Die Frage ist, ob denn überhaupt sicher gestellt ist, dass die Knackser von der AES50-Schnittstelle kommen.
Ich hatte soetwas z.B. auch mal mit der USB-Recordingkarte. Damals lag es daran, dass das Pult mal einen Schock abbekommen hat und darauf hin die Karte nicht mehr richtig saß. Einmal die Karte aus und wieder eingebaut und schon waren die Knackser weg.